Cómo eliminar un proyecto de Visual Studio Online
Pues estuve viendo en la interfaz y no encontré como. Así que me tocó a través de la línea de comandos de Visual Studio:
tfsdeleteproject /collection:https://NOMBRE-DE-CUENTA.visualstudio.com/DefaultCollection "Nombre de Proyecto"
Asegúrense de estar logueados en Visual Studio antes de ejecutar esta opción.